Im Zytoplasma werden viele zelluläre Bausteine wie Aminosäuren, Fettsäuren, Zuckermoleküle und Nucleotide synthetisiert. Auch die Glykolyse ist im Zytoplasma lokalisiert sowie ein Großteil der Proteinbiosynthese (Translation). Dabei weisen unterschiedliche Zelltypen auch ein unterschiedliches Muster von zytoplasmatischen Proteinen auf.
Die verschiedenen Ionen im Zytoplasma bilden in der Zelle ein Puffersystem, regulieren die Fluidität des Zytosols und sind für die Ladungsverteilung entlang der Membranen verantwortlich.
Mg2+-Ionen sind Cofaktoren vieler Enzyme und wichtig bei der Wechselwirkung von Proteinen
Ca2+-Ionen spielen ebenfalls eine besondere Rolle. Die Ca2+-Ionen-Konzentration der Zellen muss innerhalb ganz enger Grenzen reguliert werden, weil Ca2+ durch eine kaskadenartige Aktivierung von Proteinkinasen zahlreiche zelluläre Prozesse anstoßen kann.
Das Zytoskelett erfüllt statische und dynamische Funktionen wie
